1.会计人员思想意识较弱
将企业管理会计与财务会计两者相结合，其主体为人本身，若果在会计人员对相结合的理念不认可或者在认识上存在误差，那么将两者相结合进行管理的理念便灰飞烟灭。
由此可见，在此阶段会计人员自身的思想意识才是整个工作进行的主体，一旦会计人员不给予支持，那么将延误两者相融合的进度与效果。
在企业从事财务管理工作的会计人员其自身必须受到国家相关考试部门的认可，必须要做到持证上岗，还有一部分会计人员是退休干部依旧坚持上岗工作。
尽管在持证的情况下，部分会计人员的思想意识较弱，缺乏专业的综合素质，在实际的企业财务管理过程中不能熟练的使用财务管理系统，实际的操作能力较差，这些因素在一定程度上阻碍了管理会计与财务会计的有效结合。
2.整体的财务系统模式缺漏
在企业的管理工作中，通常是按照财务管理对管理会计与财务会计进行统筹管理的模式向下发展，然而，随着时代的不断变迁，新形势之下，管理会计在跟随时代脚步的进程中受到了企业发展规律、市场经济发展形式以及管理会计自身所具备的特征限制，未能与企业达成与时俱进的共识。
特别是在实际企业财务管理中，管理会计与财务会计在管理内容以及范围上存在着较大的差异。
通常情况下，管理会计仅仅按照企业的经济利益，便可直接制定相应的财务计划。相对于财务会计而言，其工作内容不至要将经济等问题纳入工作范围之内，同时还要将企业在进行管理时的要求进行分析，从而制定相应的财务计划，由于企业的会计准则在财务会计之上，所以会导致两者之间产生矛盾。
所以，企业的管理会计与财务会计两者能够完美融合的首要前提，便是建立完善财务系统的整体模式。
